โรงเรียนวัดเมืองสาตรก่อตั้งเมื่อ วันที่ 2 ตุลาคม พ.ศ. 2472 ในบริเวณวัดเมืองสาตรหลวง เดิมชื่อ “โรงเรียนประชาบาลตำบลหนองหอย 2” โดยก่อสร้างอาคารเรียน อาคารประกอบ ด้วยความร่วมมือร่วมใจของประชาชนในหมู่บ้าน ให้ความช่วยเหลือด้านต่าง ๆ โดยมี พระอธิการอินตา (ครูบาหล้า) เจ้าอาวาสวัดเมืองสาตรหลวง และเจ้าอธิการอิ่นแก้ว เจ้าอาวาสวัดเมืองสาตรน้อย เป็นองค์อุปการะ

เปิดเรียนครั้งแรก ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 ถึง 4 มีนักเรียนรวมทั้งสิ้น 36 คน โดยมีนายบุญช่วย ไชยวิชิต เป็นครูใหญ่คนแรก โรงเรียนก็ได้รับการพัฒนาใช้เป็นสถานที่ศึกษาเล่าเรียนของกุลบุตรกุลธิดาในหมู่บ้าน และชุมชนใกล้โรงเรียนมาโดยตลอด ในแต่ละปีเท่าที่บันทึกไว้ ดังนี้

พ.ศ. 2524 ได้ก่อตั้ง “กองทุนการศึกษาโรงเรียนวัดเมืองสาตร” ขึ้นมาโดย พระครูรัตนชัยธรรม และ

นายประสงค์ พิมสาร ครูใหญ่ ในขณะนั้นเป็นผู้ริเริ่มโดยการจัดหาทุนด้วยวิธีการต่าง ๆ มีทุนเริ่มแรกจำนวนเงิน 30,000 บาท (สามหมื่นบาท) จนกระทั่งในปัจจุบัน มีเงินในกองทุน ฯ รวมประมาณ 135,000 บาท (หนึ่งแสนสามหมื่นห้าพันบาท)

ต่อมาในปี พ.ศ. 2527 ขณะนั้น นายประสงค์ พิมสาร เป็นครูใหญ่ โรงเรียนได้รับงบประมาณจำนวน 800,000 บาท (แปดแสนบาท) เพื่อก่อสร้างอาคารเรียน แบบ สปช.105/26 ใต้ถุนโล่ง 4 ห้องเรียน ไม่สามารถทำการก่อสร้างในบริเวณวัดเมืองสาตรหลวงได้ เนื่องจากพื้นที่วัดคับแคบและเป็นที่ธรณีสงฆ์

คณะครู กรรมการศึกษาโรงเรียน ตลอดจนผู้ปกครอง ประชาชน นำโดยพระรัตนชัยธรรม เจ้าอาวาสวัดเมืองสาตรหลวง ประธานกรรมการศึกษาของโรงเรียน จึงประชุมเห็นสมควรจัดหาสถานที่เหมาะสมแห่งใหม่ สำหรับก่อสร้างเป็นโรงเรียนโดยเฉพาะเป็นเอกเทศ และได้บริจาคที่ดินจาก นายรส – นางผา ชุ่มใจ คหบดีบ้านเมืองสาตรหลวง เนื้อที่ 1 ไร่ 3 งาน 80.6 ตารางวา ราคาในขณะนั้นประมาณ ๔๐๐,๐๐๐ บาท(สี่แสนบาท) มอบให้เป็นสมบัติแก่ทางราชการเพื่อใช้เป็นที่ก่อสร้างโรงเรียนแห่งใหม่ และได้เริ่มก่อสร้างอาคารเรียน ตั้งแต่วันที่ 15 กันยายน 2527 แล้วเสร็จเมื่อวันที่ 28 มกราคม 2528 หลังจากนั้นโรงเรียนก็ได้เริ่มพัฒนาปรับปรุงอาคาร สถานที่ ต่างๆ มาเรื่อยๆ

ปัจจุบันโรงเรียนวัดเมืองสาตร เป็นโรงเรียนในสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาเชียงใหม่ เขต 1 สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ เปิดสอนตั้งแต่ ชั้นอนุบาล 2 (5 ขวบ) ถึง ชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 รวม 8 ห้องเรียน

ปรัชญา สีประจำโรงเรียน คำขวัญ และตราประจำโรงเรียน

1. ปรัชญาของสถานศึกษา สุขภาพดี มีวินัย ใฝ่เรียนรู้ คู่คุณธรรม

2. สีประจำโรงเรียน สีน้ำเงิน – ขาว

น้ำเงิน หมายถึง ความสามัคคี อดทน หนักแน่น

ขาว หมายถึง คุณธรรม จริยธรรม ความดีงาม

3. คำขวัญ สามัคคี เรียนดี มีวินัย ใฝ่คุณธรรม

4. อัตลักษณ์ ไหว้สวย

5. เอกลักษณ์ของสถานศึกษา

“รักสะอาด มารยาทงาม สืบสานวัฒนธรรม”

- รักสะอาด หมายถึง การรู้จักรักษาความสะอาดร่างกาย สถานที่ และจิตใจสะอาด

- มารยามงาม หมายถึง การมีมารยา รู้จักกาลเทศะ รู้จักเคารพบุคคลและสถานที่

- สืบสานวัฒนธรรม หมายถึง การสืบสานงานหัตถกรรมและประเพณีท้องถิ่น เช่น การทำโคม ตุง ล้านนา การเข้าร่วมกิจกรรมตามประเพณีของชุมชน

6. ตราประจำโรงเรียน ตราประจำโรงเรียนวัดเมืองสาตร ตรงกลางเป็นรูปอักษร มส อยู่ภายในตรา สพฐ. ล้อมรอบ ด้วยลายกระกนก ด้านล่างมีป้ายข้อความคำว่า สามัคคี เรียนดี มีวินัย